De penis bestaat uit verschillende onderdelen. 

Dezen zijn:

  • schacht: het 'begindeel' van de penis, tussen waar de penis start aan de onderbuik enerzijds en de eikel anderzijds. Het is een recht stuk dat uit sponsachtig weefsel bestaat. 
  • eikel (of glans): het ronde uiteinde of topje van de penis. Dit is het meest gevoelige deel van de penis.
  • plasgaatje (of meatus): de opening van de plasbuis. Het is het kleine gaatje of spleetje op de eikel. Via het plasgaatje van de man verlaten zowel urine als sperma het lichaam, maar nooit tegelijkertijd. 
  • voorhuid met voorhuidring (of collum glandis): het verhoogde cirkelvormige deel van de eikel heet corona glandis. De voorhuid beschermt de eikel tegen bacteriën en andere invloeden van de buitenwereld. De voorhuidring is doorgaans zeer gevoelig voor seksuele prikkels.
  • toompje (of frenulum): het stukje huid waarmee de voorhuid vastzit aan de eikel. Het is pas zichtbaar als de eikel helemaal ontbloot is.

Achter de penis hangt de balzak, met daarin de teelballen.